DNA提取的類(lèi)型與基本原則
核酸提取通常是開(kāi)啟生物學(xué)研究的第一步,而且提取的核酸質(zhì)量高低也是決定下游實(shí)驗成敗的關(guān)鍵因素之一,那么你知道DNA提取的類(lèi)型與基本原則是什么嗎?讓我們一起來(lái)看看吧!
一、核酸提取類(lèi)型:
1.總RNA提取
總RNA中,75-85%為rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、5S rRNA、5.8S rRNA、miRNA、siRNA、小核RNA及核仁小分子RNA等組成。
2.miRNA提取
MicroRNAs(miRNAs)是小型的、高度保守的RNA分子,如小干擾RNAs(siRNAs),通過(guò)與他們的堿基配對調節其同源mRNA的分子表達,以預防通過(guò)各種機制的表達。他們已成為進(jìn)行發(fā)育、細胞增殖、分化和細胞周期的重點(diǎn)監管機構。
3.基因組DNA提取
進(jìn)行基因結構和功能研究以及基因診斷,通常要求得到的片段長(cháng)度不小于100~200kb。在DNA提取過(guò)程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為后續的實(shí)驗打下基礎。
4.質(zhì)粒抽提
質(zhì)粒抽提方法即去除RNA,將質(zhì)粒與細菌基因組DNA分開(kāi),去除蛋白質(zhì)及其它雜質(zhì),以得到相對純凈的質(zhì)粒。
二、DNA提取的基本原則
1.保證DNA結構的完整性
不同的下游實(shí)驗對于DNA結構的完整性有所區別。如PCR、Southern雜交這一類(lèi)實(shí)驗基本保證所需片段的完整,而二代測序實(shí)驗為了獲得全面的序列信息對DNA的完整性要求更高。
2.保證DNA的純度
去除對下游實(shí)驗中酶分子有抑制作用的有機溶劑和高濃度金屬離子,將蛋白質(zhì)、多糖、多酚等生物大分子的污染降到低,去除其他核酸。
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